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Text File  |  1995-03-04  |  1.9 KB  |  40 lines
  1. *****************************
  2. * Legume lectins signatures *
  3. *****************************
  4.  
  5. Leguminous plants synthesize  sugar-binding proteins  which  are called legume
  6. lectins [1,2].   These lectins are  generally found  in the  seeds.  The exact
  7. function of legume lectins  is  not  known   but  they  may be involved in the
  8. attachment of  nitrogen-fixing  bacteria  to  legumes  and  in  the protection
  9. against pathogens.   Legume  lectins  bind  calcium  and  manganese (or  other
  10. transition metals).
  11.  
  12. Legume lectins are synthesized as precursor proteins of about 230 to 260 amino
  13. acid residues.  Some  legume  lectins are proteolytically processed to produce
  14. two chains: beta (which corresponds to the N-terminal) and alpha (C-terminal).
  15. The lectin concanavalin A (conA) from jack bean is exceptional in that the two
  16. chains are transposed  and ligated (by formation of a new peptide  bond).  The
  17. N-terminus of mature conA thus corresponds to that of the  alpha chain and the
  18. C-terminus to the beta chain.
  19.  
  20. We have developed two signature patterns specific to legume lectins: the first
  21. is  located  in  the  C-terminal  section  of  the  beta  chain and contains a
  22. conserved aspartic acid   residue  important  for  the  binding of calcium and
  23. manganese; the second one is located in the N-terminal of the alpha chain.
  24.  
  25. -Consensus pattern: [LIV]-[STAG]-V-[EQV]-[FLI]-D-[ST]
  26.                     [D binds manganese and calcium]
  27. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  28. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 3.
  29.  
  30. -Consensus pattern: [LIV]-x-[EDQ]-[FYWKR]-V-x-[LIV]-G-[LF]-[ST]
  31. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  32. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  33.  
  34. -Last update: June 1994 / Patterns and text revised.
  35.  
  36. [ 1] Sharon N., Lis H.
  37.      FASEB J. 4:3198-320(1990).
  38. [ 2] Lis H., Sharon N.
  39.      Annu. Rev. Biochem. 55:33-37(1986).
  40.